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中国科学院自动化研究所
中国科学院自动化研究所成立于1956年10月，是我国最早成立的国立自动化研究机构和最早开展类脑智能研究的国立研究机构。自动化所现设科研开发部门14个，包括模式识别国家重点实验室、复杂系统管理与控制国家重点实验室、国家专用集成电路设计工程技术研究中心、中国科学院分子影像重点实验室、脑网络组研究中心等科研部门。还有若干与国际和社会其他创新单元共建的各类联合实验室和工程中心。
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中国科学院福建物质结构研究所
福建物构所由我国著名科学家、教育家卢嘉锡院士于1960年创建，是中科院优秀研究所。海西研究院以福建物构所为基础和法人依托，下设物质结构研究所、材料工程研究所、先进制造技术集成研究所、厦门稀土材料研究所、泉州装备制造研究所等5个研究所及海峡两岸科技合作交流中心和中科院海西育成中心。
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中国科学院动物研究所
中国科学院动物研究前身是1928年成立的静生生物调查所、1929年成立的北平研究院动物学研究所和1930年成立的中央研究院动物研究所。动物研究所是以动物科学基础研究为主的社会公益型国家级科研机构。以野生动物和模式动物为研究对象，开展现代动物学研究，服务于人口健康、农业和生物多样性保护等国家重大需求。在细胞编程与重编程的机制、生殖与发育调控、生物灾害爆发机制与控制、物种濒危机制与保护等领域发挥引领作用；在动物分类与进化、农业虫鼠害防控和濒危动物保护中发挥不可替代的作用。动物研究所主办的学术刊物有7种，分别是《Current Zoology》、《Insect Science》、《Integrative Zoology》、《昆虫学报》、《动物分类学报》、《动物学杂志》、《应用昆虫学报》。
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中国科学院植物研究所
中国科学院植物研究所是我国植物科学的综合研究机构，植物所现有7个研究和支撑部门、8个野外台站、1个亚洲最大的植物标本馆、1个公共技术服务中心和中国生态系统研究网络（CERN）生物分中心。研究和支撑部门包括2个国家重点实验室（系统与进化植物学国家重点实验室、植被与环境变化国家重点实验室）、3个中国科学院重点实验室（中科院植物分子生理学重点实验室、中科院光生物学重点实验室、中科院北方资源植物重点实验室）、北京植物园（含华西亚高山植物园）、文献与信息管理中心。中科院内蒙古草业研究中心依托于植物所。
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中国科学院青藏高原研究所
青藏高原所于2003年成立。研究所实行北京部、拉萨部和昆明部的“一所三部”运行模式，还在加德满都、伊朗、塔吉克建有海外科学中心。研究所现有环境变化与地表过程、大陆碰撞与高原隆升、高寒生态与人类适应和三极观测与大数据4个研究中心，有环境变化与地表过程、大陆碰撞与高原隆升和高寒生态3个院重点实验室和1个国家青藏高原科学数据中心。拥有7个野外观测台站（中心），分别是纳木错多圈层、珠穆朗玛大气与环境、藏东南高山环境、阿里荒漠环境、慕士塔格西风带、那曲高寒气候环境等综合观测研究站和墨脱地球景观与地球系统综合观测研究中心。
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中国科学院地质与地球物理研究所
中国科学院地质与地球物理研究所是1999年6月由中国科学院地质研究所和中国科学院地球物理研究所整合而成。2004年，中国科学院武汉物理与数学研究所电离层研究室整体调整到本所。研究所建有岩石圈演化国家重点实验室，以及地球与行星物理、页岩气与地质工程、矿产资源研究、油气资源研究、新生代地质与环境等五个中国科学院重点实验室和深部资源探测先导技术与装备研发中心。，目前已建成地球物质成分与性质分析、地质年代学测定、地球内部结构探测、空间环境观测野外台站、古环境数据分析、数据计算处理与数值模拟、深部资源勘探装备研发等七大技术平台系列，具备了对从空间地磁环境观测到地球深部探测与数值模拟进行全方位综合研究的能力。
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