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中国科学院上海技术物理研究所
上海技物所创建于1958年10月，是集基础研究、工程技术研发和高新技术产业化为一体的综合型研究机构。上海技物所以红外物理与光电技术研究为定位，以红外光电新材料、新器件、新方法等作为主要研究方向，重点发展先进的航空航天有效载荷、红外凝视成像及信号处理、红外焦平面及遥感信息处理等技术。设有研究室13个，建有红外物理国家重点实验室、传感技术联合国家重点实验室（光传感器专业点）、中科院红外成像材料与器件重点实验室、中科院红外探测与成像技术重点实验室、中科院空间主动光电技术重点实验室、中科院智能红外感知重点实验室以及省部共建现场物证光学探测技术联合实验室。
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中国科学院上海光学精密机械研究所
上海光机所成立于1964年5月，是我国建立最早、规模最大的激光科学技术专业研究所。研究所重点学科领域为：强激光技术、强场物理与强光光学、空间激光与时频技术、信息光学、量子光学、激光与光电子器件、光学材料等。上海光机所现设14个研究室，拥有国家重点实验室1个、“中科院-中物院”联合实验室1个、中科院重点实验室4个、上海市重点实验室1个。
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中国科学院上海硅酸盐研究所
上海硅酸盐所渊源于1928年成立的国立中央研究院工程研究所，1953年更名为中国科学院冶金陶瓷研究所。1959年独立建所，定名为中国科学院硅酸盐化学与工学研究所，1984年改为现名。学科方向是先进无机材料科学与工程，主要研究领域覆盖了高性能结构陶瓷、功能陶瓷、透明陶瓷、陶瓷基复合材料、人工晶体、无机涂层、能源材料、生物材料、古陶瓷以及先进无机材料性能检测与表征等，是国内该领域科学研究单位中门类最为齐全的研究所。
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中国科学院上海有机化学研究所
上海有机所是集基础研究、应用研究和高技术创新研究为一体的综合性化学研究机构，创建于1950年5月，是中国科学院首批成立的15个研究所之一，前身是建立于1928年7月的前中央研究院化学研究所。上海有机所战略定位为：立足基础交叉前沿领域，坚持重大科学问题和国家重大需求导向，发挥有机合成化学的创造性，加强与生命科学、材料科学的交叉与融合；致力于推动我国化学转化方法学、化学生物学、有机新材料创制科学等重点学科领域的发展；在有机化学基础研究、新医药农药和高性能有机材料创制方面实现新的突破；引领有机化学学科前沿的发展，满足国家战略需求，服务国民经济主战场；将上海有机所建设成为国际一流的有机化学研究中心。
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生物化学与细胞生物学研究所
生化与细胞所）成立于2000年5月，由原中国科学院上海生物化学研究所与原中国科学院上海细胞生物学研究所整合而成。生化与细胞所是我国生命科学领域最具科研实力和影响力的国立研究机构之一。研究所定位于生命科学基础研究，在PI制的基础上，针对当今生物化学和细胞生物学主要前沿研究方向，围绕国家重点实验室和研究中心形成了三大研究集群，涵盖五大前沿领域。形成了以分子生物学国家重点实验室、细胞生物学国家重点实验室、国家蛋白质科学研究中心•上海（筹）为支撑的三大研究集群，涵盖基因调控、RNA、表观遗传学，蛋白质科学，细胞信号转导，细胞与干细胞生物学，癌症和其它重大疾病机理五大前沿领域。
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中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）
中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心是中国科学院依据“率先行动”计划、在脑科学与智能技术领域设立的卓越创新中心。中心目标：以脑认知功能的神经基础、类脑智能计算模型为核心科学问题，通过脑科学与智能技术的交叉融合，取得重大创新成果；研发脑研究新技术，针对国家重大需求，开展脑疾病机理研究与早期诊断和干预手段研发等有应用前景的前沿工作；利用我国交叉学科的专长、脑疾病样本的丰富资源和非人灵长类动物模型的优势，在脑科学前沿领域，取得国际领先的成果；研究并借鉴脑信息处理机制，通过类脑器件、芯片和类脑机器人等系统的突破，实现类脑智能软硬件系统，引领我国智能产业的发展，增强国际竞争力。
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中国科学院长春应用化学研究所
中国科学院长春应用化学研究所始建于1948年12月，现已发展成为集基础研究、应用研究和高技术创新研究及产业化于一体，在国内外享有崇高声誉和影响的综合性化学研究所，成为我国化学界的重要力量和创新基地。学科方向：高分子化学与物理、无机化学、分析化学、有机化学和物理化学和应用化学，拓展生物化工学科。主要研究领域：聚焦先进材料、资源生态环境和人口健康等三大领域。
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中国科学院东北地理与农业生态研究所
中国科学院东北地理与农业生态研究所，是中国科学院设在东北地区的综合性地理学、农学、生态学、环境科学与技术研究机构和人才培养基地，于2002年由原中国科学院长春地理研究所和原中国科学院黑龙江农业现代化研究所整合组建而成。研究所重点开展农业生态、湿地生态、遥感与地理信息、环境与区域发展等学科领域的研究，旨在为保障国家粮食安全、生态安全和东北老工业基地振兴做出基础性、战略性和前瞻性贡献。研究所构筑了包括3个中国科学院重点实验室、2个研究中心、12个野外实验站，24个农业研究与示范基地的科学研究及技术示范体系。
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